Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trim71Q1PSW8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trim71Q1PSW8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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