Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppp4r2Q0VGB7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp4r2Q0VGB7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms