Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntnap5cQ0V8T7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms