Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rab42Q0PD08 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab42Q0PD08 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms