Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Vps8Q0P5W1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Vps8Q0P5W1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Vps8Q0P5W1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Vps8Q0P5W1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms