Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ttc21bQ0HA38 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ttc21bQ0HA38 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ttc21bQ0HA38 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms