Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnnm1Q0GA42 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnnm1Q0GA42 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms