Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cass4Q08EC4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cass4Q08EC4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cass4Q08EC4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms