Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbp2Q08652 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp2Q08652 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms