Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tff1Q08423 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tff1Q08423 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tff1Q08423 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tff1Q08423 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tff1Q08423 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tff1Q08423 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tff1Q08423 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tff1Q08423 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tff1Q08423 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tff1Q08423 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tff1Q08423 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tff1Q08423 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tff1Q08423 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tff1Q08423 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tff1Q08423 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tff1Q08423 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tff1Q08423 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tff1Q08423 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tff1Q08423 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms