Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gata4Q08369 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata4Q08369 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms