Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CbfbQ08024 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 222.1 ms