Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdx4Q07424 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdx4Q07424 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms