Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nfe2Q07279 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms