Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Siah1bQ06985 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Siah1bQ06985 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms