Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cab39Q06138 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cab39Q06138 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms