Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Fmn1Q05860 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Fmn1Q05860 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Fmn1Q05860 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Fmn1Q05860 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms