Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox10Q04888 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox10Q04888 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox10Q04888 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms