Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox9Q04887 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox9Q04887 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox9Q04887 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox9Q04887 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox9Q04887 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox9Q04887 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox9Q04887 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox9Q04887 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox9Q04887 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox9Q04887 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox9Q04887 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox9Q04887 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox9Q04887 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox9Q04887 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox9Q04887 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox9Q04887 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox9Q04887 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox9Q04887 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox9Q04887 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox9Q04887 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox9Q04887 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox9Q04887 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox9Q04887 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox9Q04887 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox9Q04887 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox9Q04887 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox9Q04887 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox9Q04887 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox9Q04887 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox9Q04887 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox9Q04887 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox9Q04887 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms