Protein–RNA interactions for Protein: Q03401

Crisp1, Cysteine-rich secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp1Q03401 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Crisp1Q03401 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Crisp1Q03401 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Crisp1Q03401 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms