Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Runx1Q03347 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Runx1Q03347 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Runx1Q03347 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Runx1Q03347 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Runx1Q03347 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Runx1Q03347 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Runx1Q03347 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Runx1Q03347 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Runx1Q03347 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Runx1Q03347 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Runx1Q03347 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Runx1Q03347 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Runx1Q03347 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Runx1Q03347 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Runx1Q03347 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Runx1Q03347 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Runx1Q03347 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Runx1Q03347 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Runx1Q03347 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Runx1Q03347 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Runx1Q03347 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Runx1Q03347 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Runx1Q03347 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Runx1Q03347 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Runx1Q03347 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Runx1Q03347 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Runx1Q03347 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Runx1Q03347 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Runx1Q03347 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Runx1Q03347 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Runx1Q03347 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Runx1Q03347 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Runx1Q03347 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Runx1Q03347 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Runx1Q03347 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Runx1Q03347 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Runx1Q03347 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Runx1Q03347 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Runx1Q03347 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Runx1Q03347 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Runx1Q03347 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Runx1Q03347 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms