Protein–RNA interactions for Protein: Q03172

Hivep1, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 2,688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep1Q03172 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hivep1Q03172 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hivep1Q03172 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms