Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Col6a2Q02788 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col6a2Q02788 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms