Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nhlh1Q02576 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nhlh1Q02576 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nhlh1Q02576 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms