Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Muc1Q02496 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Muc1Q02496 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Muc1Q02496 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms