Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ascl1Q02067 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms