Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms