Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Top2aQ01320 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Top2aQ01320 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Top2aQ01320 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Top2aQ01320 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Top2aQ01320 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Top2aQ01320 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Top2aQ01320 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Top2aQ01320 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Top2aQ01320 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Top2aQ01320 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Top2aQ01320 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Top2aQ01320 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Top2aQ01320 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Top2aQ01320 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Top2aQ01320 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Top2aQ01320 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Top2aQ01320 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Top2aQ01320 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Top2aQ01320 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Top2aQ01320 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Top2aQ01320 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Top2aQ01320 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Top2aQ01320 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Top2aQ01320 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms