Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EgfrQ01279 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EgfrQ01279 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms