Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VegfaQ00731 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VegfaQ00731 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VegfaQ00731 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VegfaQ00731 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VegfaQ00731 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VegfaQ00731 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VegfaQ00731 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VegfaQ00731 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VegfaQ00731 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VegfaQ00731 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
VegfaQ00731 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VegfaQ00731 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VegfaQ00731 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VegfaQ00731 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VegfaQ00731 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VegfaQ00731 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VegfaQ00731 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VegfaQ00731 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VegfaQ00731 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VegfaQ00731 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VegfaQ00731 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VegfaQ00731 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VegfaQ00731 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VegfaQ00731 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VegfaQ00731 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VegfaQ00731 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VegfaQ00731 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VegfaQ00731 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VegfaQ00731 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VegfaQ00731 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VegfaQ00731 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VegfaQ00731 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VegfaQ00731 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VegfaQ00731 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VegfaQ00731 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VegfaQ00731 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VegfaQ00731 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VegfaQ00731 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
VegfaQ00731 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VegfaQ00731 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VegfaQ00731 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VegfaQ00731 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VegfaQ00731 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VegfaQ00731 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VegfaQ00731 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VegfaQ00731 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VegfaQ00731 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VegfaQ00731 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VegfaQ00731 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VegfaQ00731 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VegfaQ00731 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VegfaQ00731 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VegfaQ00731 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VegfaQ00731 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VegfaQ00731 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VegfaQ00731 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms