Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SeleQ00690 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SeleQ00690 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SeleQ00690 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SeleQ00690 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SeleQ00690 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SeleQ00690 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SeleQ00690 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SeleQ00690 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SeleQ00690 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SeleQ00690 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SeleQ00690 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms