Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabpb1Q00420 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabpb1Q00420 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms