Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou1f1Q00286 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou1f1Q00286 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou1f1Q00286 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou1f1Q00286 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou1f1Q00286 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou1f1Q00286 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou1f1Q00286 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou1f1Q00286 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou1f1Q00286 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou1f1Q00286 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou1f1Q00286 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou1f1Q00286 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou1f1Q00286 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou1f1Q00286 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou1f1Q00286 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou1f1Q00286 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou1f1Q00286 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou1f1Q00286 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou1f1Q00286 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms