Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Stx2Q00262 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Stx2Q00262 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Stx2Q00262 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Stx2Q00262 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Stx2Q00262 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx2Q00262 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx2Q00262 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx2Q00262 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx2Q00262 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx2Q00262 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx2Q00262 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx2Q00262 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx2Q00262 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx2Q00262 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx2Q00262 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx2Q00262 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx2Q00262 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx2Q00262 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx2Q00262 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx2Q00262 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms