Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cds1P98191 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cds1P98191 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cds1P98191 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Cds1P98191 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cds1P98191 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cds1P98191 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cds1P98191 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cds1P98191 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms