Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shc1P98083 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shc1P98083 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shc1P98083 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shc1P98083 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shc1P98083 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shc1P98083 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shc1P98083 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Shc1P98083 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shc1P98083 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms