Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lama4P97927 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lama4P97927 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lama4P97927 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lama4P97927 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Lama4P97927 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lama4P97927 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lama4P97927 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Lama4P97927 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lama4P97927 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lama4P97927 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lama4P97927 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lama4P97927 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lama4P97927 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lama4P97927 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lama4P97927 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lama4P97927 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Lama4P97927 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lama4P97927 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms