Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfra1P97785 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms