Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smyd1P97443 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smyd1P97443 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms