Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nkx2-3P97334 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx2-3P97334 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nkx2-3P97334 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms