Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

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Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkdcP97313 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkdcP97313 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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