Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mesp1P97309 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms