Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms