Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx1P81068 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx1P81068 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx1P81068 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx1P81068 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx1P81068 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx1P81068 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx1P81068 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx1P81068 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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