Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irx3P81067 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irx3P81067 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irx3P81067 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Irx3P81067 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx3P81067 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx3P81067 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irx3P81067 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irx3P81067 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Irx3P81067 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms