Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx2P81066 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx2P81066 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Irx2P81066 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx2P81066 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx2P81066 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx2P81066 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx2P81066 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms