Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Otx2P80206 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx2P80206 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otx2P80206 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otx2P80206 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otx2P80206 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otx2P80206 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otx2P80206 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms