Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sycp3P70281 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms