Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chl1P70232 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Chl1P70232 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chl1P70232 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chl1P70232 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms