Protein–RNA interactions for Protein: P68181

Prkacb, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkacbP68181 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkacbP68181 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkacbP68181 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkacbP68181 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkacbP68181 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkacbP68181 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkacbP68181 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkacbP68181 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkacbP68181 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkacbP68181 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkacbP68181 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkacbP68181 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkacbP68181 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkacbP68181 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkacbP68181 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkacbP68181 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkacbP68181 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkacbP68181 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkacbP68181 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkacbP68181 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkacbP68181 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkacbP68181 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkacbP68181 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkacbP68181 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkacbP68181 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkacbP68181 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkacbP68181 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkacbP68181 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkacbP68181 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkacbP68181 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkacbP68181 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkacbP68181 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkacbP68181 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PrkacbP68181 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkacbP68181 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkacbP68181 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkacbP68181 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkacbP68181 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms